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    小桔灯网»社区 › C、IVD技术区 › 生物信息服务 › 生物信息学基础知识（二）

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    [分享] 生物信息学基础知识（二）

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    风云
    发表于 2025-2-20 14:03 | 显示全部楼层 |阅读模式 <

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    序列比对
    一、序列比对及计分矩阵
    1、全局比对
    针对全长序列进行比对
    2、局部比对
    得到序列比对中得分最高的片段
    <hr/>常用比对软件
    bwa
    blast系列
    hisat2
    bowtie2
    minimap2
    diamond
    <hr/>系统发生树构建
    一、基于SNP
    1、距离矩阵法
    （1）UPGMA法
    （2）邻接法
    （3）最小进化法
    2、最大似然法
    3、最大简约法
    4、贝叶斯法
    二、基于字符串
    1、基因组组分矢量法
    <hr/>常见组学
    基因组
    转录组
    表观组
    蛋白质组
    代谢组
    单细胞组
    免疫组
    微生物组

    原文地址：https://zhuanlan.zhihu.com/p/622559365
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